ブータン女子サッカー代表チームは、2010年に初の国際試合を行った比較的新しいナショナルチームです。チームはアジアサッカー連盟（AFC）および南アジアサッカー連盟（SAFF）に加盟するブータンサッカー連盟が管轄しており、ホームゲームはティンプーのチャンリミタン・スタジアムで開催されます。
国際大会への参加以前、ブータンには女子クラブチームが存在しませんでした。FIFAの助成を受けたブータンサッカー連盟が、各ゾンカク（行政区）を代表するチームによる国内大会を初めて組織し、女子サッカーの普及と代表候補選手の発掘・育成の場として機能させました。この取り組みが、初の女子代表チーム結成への道を開きました。
2010年12月、バングラデシュとの親善試合で競技デビューを果たし、その直後に第1回SAFF女子選手権に出場しました。初戦ではインドに0–18、バングラデシュに0–9と大敗を喫しましたが、スリランカとの最終戦で1–1の引き分けを収め、チーム史上初のゴールと勝ち点を記録しました。その後約2年間は国際舞台から離れ、2012年のSAFF女子選手権で復帰。全員が学生で構成されたチームは、バンコクでの事前合宿を経てスリランカの大会に臨みました。
2024年10月にはモルディブを13–0で下し、チーム史上最大の勝利を記録しました。現在もSAFF女子選手権やAFC女子アジアカップ予選を中心に活動を続け、南アジア地域でのさらなる発展を目指しています。